La aprobación de Patrimonio permite la licitación del contrato de obras para la reforma del histórico cenobio y su entorno. Este proyecto, que se anunció en 2021 con una previsión de finalización en 2025, ha sufrido un retraso considerable, ya que la obra debía haber concluido hace un año.

El presupuesto inicial, cifrado en 18,4 millones de euros hace cinco años, no ha sido actualizado por la Junta, aunque se espera que aumente debido al incremento del precio de los materiales, especialmente tras la guerra de Ucrania.

Desde que el Convento de la Trinidad pasó a ser propiedad de la Junta de Andalucía en 2005, se han barajado diversas propuestas para su uso, incluyendo un parque de los cuentos, la sede de la Biblioteca Provincial, un centro internacional de arte rupestre o un museo de diseño industrial y arquitectura. El alcalde de Málaga siempre ha manifestado su interés en que el espacio albergue un museo, concretamente el arqueológico de la ciudad.

El proyecto de rehabilitación incluye un estudio exhaustivo del bien, declarado Monumento Histórico-Artístico en 1980 y Bien de Interés Cultural (BIC) cinco años después. Se realizará un diagnóstico de su estado actual, una propuesta de actuación y un programa de mantenimiento, asegurando la compatibilidad de los métodos constructivos con la tradición del edificio.

Además de la restauración del edificio original, que acogerá salas de exposiciones y espacios polivalentes para actividades escénicas, musicales y literarias, se contempla la construcción de un nuevo edificio semienterrado. Este conectará el convento con el Archivo Histórico Provincial de Málaga, también BIC, y albergará el Archivo Provincial Intermedio, el primero de su tipo en Andalucía.

El espacio público circundante al cenobio, construido entre los siglos XV y XVI, se diseñará para recrear la antigua huerta del convento, con un jardín y huerto medicinal en la entrada del centro cultural y especies de huerta de temporada en la zona norte, vinculando el lugar con su historia agrícola.